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§どうせモテないし、白血病解析でもやろうぜ!2§

1 : ◆R0eWkIpk :02/05/20 18:45
§§§§ どうせモテないし、白血病解析でもやろうぜ! Part2 §§§§

小児死亡原因のトップ、白血病の治療薬研究では癌に耐性があるとされる
数億種類の分子を検証しなければならない。この作業を完了するには
米国立癌研究財団が最低で2,400万時間必要だという。これを促進するために
インテルと欧米の科学研究団体などが中心となって発表した、
インターネットに接続された世界中のパソコンの余剰パワーを利用して
検証時間を短縮するというプロジェクトです。
 http://www.forest.impress.co.jp/article/2001/04/05/udagent.html

モナー板よりUDのフラッシュ
 http://www.geocities.co.jp/MotorCity-Rally/9190/swf/UD2-mona.swf

インストールの方法は>>2、関連リンクは>>3あたり
みんな、一緒にハァハァしる!

 = どうせモテないけど、誰かのために =


365 :Mr.名無しさん:02/06/25 00:53
俺はパソコンの電源切るたびに0%に戻ってる
ちゃんと三日月にしてからきってるのに・・・

366 :hitsuji@ノハ@male:02/06/25 01:37
>>364 Mr.名無しさん
proxy云々ってどんなふうにでるんでしょうか?
一度もみたことないので、、、ってすぐにでるんですかね

>>365 Mr.名無しさん
「三日月」の後にスライムの上で鼠の逆ボタン押して「EXIT」選択してます?
以前三日月だけやってマシンリブートしたら0%に戻ってて悲しくなったことあります。

367 :Mr.名無しさん:02/06/25 05:38
1はどこ逝った?

368 :365:02/06/25 10:22
>>366
うん、そうしてます
今まではそのやり方でちゃんとできてたのに
この前の罰金のときから保存されなくなったみたい

369 :Mr.名無しさん:02/06/25 11:35
>>368
あちこちの板で同事象が発生しているんですが、
結論として、その宿題は捨てた方が良いです。

で、直す手段なのですが、新しい宿題取った時に直るとか、
再インストールが必要とかいろいろ話が出ています。

ラウソジとか初心者板とかで確認してみてください。
(漏れ自身は、しばらく様子見た方がいいような気もしてまふ)

370 :Mr.名無しさん:02/06/25 14:17
0%に戻っちゃうの厄介だよね。
ガイシュツだと思うけど、休止状態を利用した方がいいのかな。

371 :364:02/06/25 17:00
なんかわかんないけどできました
でも@maleじゃないぽ

372 :365:02/06/25 20:41
一度捨てたら保存されるようになったみたいです
お騒がせしました

373 :独身匪賊@1:02/06/25 22:31
みなさん今晩は。(・∀・)オパーイ


>>363
hitsuji タン 仕事は嫌でもやらねばならぬところが辛いですね。(;´Д`)


さて、UD の CEO がとうとう公式声明をだしましたね。ラウンジに
行った方は既にご存知と思いますが、7月から LigandFit という
名前のプログラムを THINK に替えて解析プロジェクトを Phase 2
に進めるそうです。

THINKでは大まかに有望な結果を示す蛋白質を抽出しましたが、LigandFits
では更に詳細な精密化を試みる事によって更に合成と治検のための新薬の
セットを導く、小さなリストを作成することになるそうです。

言い替えると、Phase 1 の成功により、有望な蛋白質のシリーズが
みつかったわけですね。みなさん、おめでとう。




374 :独身匪賊@2:02/06/25 22:33
余談ですが、 THINK のプログラマーがUDプロジェクトから移ると
聞いた時、UDが既に有望な蛋白質のリストを手に入れたのではないか
という推測を個人的にしてました。RAFが異常に多かったのを覚えて
おられるでしょうか?あれは、THINKのライセンスが切れる前に
流した検算のためのワークユニットであったに違いないと思います。
なお、みなさんの THINK の結果について面白い統計が出てまして、
hits の中にも crude (ゴミ)と good hits(当たり)があった
そうです。 http://www.find-a-drug.com/news1.html

さて、以前お話した通り。今後、THINKの方は別会社の元で、同じ目的を
目指した別のプロジェクトとなるわけですが、既に THINK はバージョン
1.14i までマイナーバージョンアップを繰り返しておりまして、こちら
は更に軽く、また別のアルゴリズムを組み込んだソフトとして開発が
進んでいます。UD と決して喧嘩別れしたわけではなさそうですが、
やはり色々食い違いがあったようで、この辺りは表沙汰になることは
なさそうですね。

この会社では今まで通り THINK による Cancer プロジェクトを進めると
共に HIV のプロジェクトを夏からスタートするそうです。ターゲットの
蛋白質も増やされているので、7月以降もしもUDの新しいプログラムが
うまく走らなかったら、こちらのプロジェクトに参加するのも良いかも
知れません。新しい会社の WEB URL は以下の通りです。
http://www.find-a-drug.com/

長くなったので、今日はこの辺でまた止めておきます。おぱーい(・∀・)


375 :Mr.名無しさん:02/06/26 01:34
独身匪賊タン・・・毎度毎度詳しく解説してくれてアリガトンヽ(´ー`)ノ

376 :Mr.名無しさん:02/06/26 01:51
オヤスミ前のage!

>>374-375
おおぅ!また、詳しい解説をありがとうございます。
HIVのためのプロジェクトっていうのもあるんですか〜
難しいとはいえ、白血病には骨髄移植という治療法があるのに比べて
HIVは、それに匹敵するほどの有効な手段がないですからね。
そのプロジェクトで、いつの日か特効薬が出来れば・・・。

377 :Mr.名無しさん:02/06/26 09:37
>376
恐れる事は中出汁だけですな(w
相手居ネーヨ わるかったな(涙

378 :macy@male@略:02/06/26 09:56
こんにちは〜
番外編なんですけど、すごいのが送られてきたからご紹介。
ttp://www.geocities.co.jp/NatureLand-Sky/3447/oubo.htm

@maleの皆様のご健闘を祈りつつ、ご応募お待ちしています。

379 :hitsuji@ノハ@male:02/06/26 10:21
「三日月」→「EXIT」して、ますんリブートしたら0%になりました
38時間がみずのあわになりました。そんなことされたら石鹸の国に行きたくなるぞ
もうこの方法では終了直前の常態を保持できないみたいですね。

380 :Mr.名無しさん:02/06/26 19:51
再起動すると0%になるのはこーゆーことらしいです
http://cocoa.2ch.net/test/read.cgi/qa/1022244285/509



381 :Mr.名無しさん:02/06/26 23:16
>>378
おぉ〜っ 惜しい!
こういう楽しみ方もあったんですね (・∀・)ノイ

382 :Mr.名無しさん:02/06/26 23:28
>>381
惜しい? あぁ一番上のやつね。
でも、多分見てほしいのは一番下のやつだと思われ。

383 :hitsuji@ノハ@male:02/06/27 02:27
>>380 Mr.名無しさん
情報サンクス!
バグフィックスされたものだあるのかぁ、今週末でもやってみますぅ

384 :Mr.名無しさん:02/06/27 21:25
>>382
あ た り

385 :Mr.名無しさん:02/06/28 04:24
煩悩魔人タンのいる株板も精力を伸ばしてきてるなー
ちょうどここと同じ人数になったね

386 :Mr.名無しさん:02/06/28 11:45
1人増えてる!!!!!
引っ越ししてくれたのか?
bakatank@maleタン、おぱ〜い

387 :hitsuji@ノハ@male :02/06/28 12:09
bakatank@maleタン、よろしくのage

388 :独身匪賊:02/06/28 21:57
みなさん今晩は、おぱーい(・∀・)
bakatank@maleタン 歓迎です。( ´v`)ノ ヨロシクネ

>>375
どうも恐れ入ります。余り礼を言われると木に登ってしまい
そうです。役に立っているといいけどなぁと思います。(・∀・)オパーイ

>>376
ええ、そうですね。白血病とHIVの他に

○老年病(アルツハイマー病、筋萎縮硬化症 etc.)
○農薬公害(ダイオキシン癌 etc.)
○バイオテロリズム用解毒薬
○新薬候補を絞るための新しいアルゴリズムのテスト

が解析対象に挙がっています。私も7月から、UDに割いている
3台のマシンのうち、1台を参加させようと思ってます。Win95 で
解析をしていた人にも声をかけてこちらでもTeam 2ch を作り
ましょうか?(・∀・)ナカマ ガ フエルト イイナ
>>383
恐らく、いきなり LigandFit がやってくるでしょう(・∀・)

LigandFit が配布され始めますた。これに合わせて
UDから公式の情報が追加されますた。

http://forum.ud.com/ubbcgi/ultimatebb.cgi?ubb=get_topic;f=1;t=000138
http://forum.ud.com/ubbcgi/ultimatebb.cgi?ubb=get_topic;f=22;t=000051
http://forum.ud.com/ubbcgi/ultimatebb.cgi?ubb=get_topic;f=2;t=000029

内容は LigandFit のスペック、動作、要求される環境について等で、
特に2番目と3番目は目を通して置いた方がいいかもしれません。
こちらの手元にも一台 LigandFit を受け取ったマシンがあるのですが、
CPUの空き時間を使っているとはいえ、重そうに見えます。(--;)ウツダ

Phase II の雰囲気がつかめるのは来月になってからでしょうね。
では今日はこれから酔っ払う予定なので失礼します。良い週末を!
(・∀・)タマニハ ネニチリーン!

389 :bakatank@male:02/06/28 22:02
ちいっす。
UDは暫く自家発電だったんですが、なんとなくTeam2Chに入る気になったので、
折角だから俺は赤の扉違った毒男板に所属させて貰う事にしました。よろしゅ。
いや、なんとなく板の雰囲気がマターリしているのが気に入ったモノでして。

そいや、Thinkに変わってLigandfit来ましたなあ。
とりあえずThinkと比較して重いっつー事はないですが、分子モデルがポリゴンに
なっていたり、インテルのマークが無くなったり、色々変化がありますね。

390 :hitsuji@ノハ@male:02/06/28 23:23
>>389 bakatank@maleタン
>分子モデルがポリゴンに
OpenGL使っているようです。
OpenGL対応のグラフィックチップならCPUパワーあまり取られないけど・・・

>>388 独身匪賊タンの教えてくれたリンクの最後の奴に書いてあったのを
翻訳こんにゃくしたものを以下に・・・

一般的な情報:
・LigandFitはエネルギー・グリッド計算の実行によりスタートします。
・すべての配位子の後のLigandFitチェックポイント。
・チェックポイントから再開する場合、LigandFitはエネルギー・グリッド計算を再び実行するに違いありません。
・LigandFitは、グラフィックスを表示するためにOpenGlを使用します。
  Windows98の、およびオープンGLソフトウェアdllを備えた船の上のすべてのバージョン。
  最新のオープンGL dllを必要とするあなた自身がhttp://www.opengl.orgをチェックすることを知る場合。
・グラフィックスが表示されている一方、UD.exeは、グラフィックスを実行するためにあるCPUを使用するでしょう。
  LigandFitグラフィックスが表示されない場合、UD.exeはこの余分なcpu時をとらないでしょう。
・最小の自由なRAMあるいはVMを持っている場合、グラフィックスは表示されないでしょう、しかしhttpで旗のように見える、静止のグラフィックス(その代りに)://www.chem.ox.ac.uk/curecancer.html。
・参加するために32MBのRAM最小を持っていなければなりません。
・LigandFit workunitsはサイズで150Kまででありえます。
  現在のworkunitsは各workunitに300の配位子を持っています。
・第1のresdataはサイズで63Kです。
・LigandFit結果は前のプロジェクトより大きい。
  現在の期待は500Kの範囲にあります。Workunitsが長さで〜20時間であると予想されます。
  私たちは方法がこれをより小さなアップロードにしているのを見つけるために働いています。


391 :hitsuji@ノハ@male:02/06/28 23:33
はげしくみにくいですね・・・
ではつづき

既知問題:
・チェックポイントから配位子進行計算を再開することが300のうちの0を表示する場合、
  ない、上にやめた位置。一旦次の配位子が到達すれば、これは変わるでしょう。
  主要なページに、チェックポイントから再開する場合、完全なパーセントおよび
  cpu時間はパーセントと時間を始めて示します。私たちはそれが上に(つまり300の40.)
  やめた配位子を示すように、この振る舞いを固定するために働いています。
・蛋白質名か記述のディスプレイは現在ありません。
  私たちはこれを提供するために働いています。
・配位子3D構造は塩素を適切に表示しません。
  それは、Carbonのような灰色を暴露するでしょう。
  これはディスプレイ問題だけです。進行中の位置。
・タスク・グラフィックス・スクリーンを分離することは可能です。
  修正するために、タスク・グラフィックス・ウィンドウおよび
  UD代理人ウィンドウを最小限にします。
  あなたがタスク・グラフィックスを最小限にする前に
  UD代理人を最小限にすれば、タスク・グラフィックス・ウィンドウ中の
  他のボタンをクリックすることにより、
  ランタイムエラー「384」を得ることは可能です。
  エラー・ウィンドウを取り除く時、代理人は終了するでしょう。
  位置は進行中です。
・グラフィックス・スクリーンに仕事を課するために変わる場合A休止は
 存在します。タスク・グラフィックスへのスイッチは即時ではありません、
 また、それは、適正な機械を数秒積み込むことができ少し、
 グラフィックス・ページが表示するべきより遅い機械をより十分に
 有している私たちは、これを促進し続ける方法を捜しています。

あまりにも、機械的翻訳だなぁ〜まぁ参考までにってことで・・・


392 :381:02/06/29 09:22
アフォまるだしですた。スマソ、逝ってきます‥。。
また、罰金になってる〜

393 :Mr.名無しさん:02/06/29 09:29
俺も今回からLIGANDFITになった。
ターゲットの名前はわからないけど、
はだエプよりは柔らかそう。

394 :hitsuji@ノハ@male:02/06/29 20:54
www.aopen.co.jpのトップページ・・・

にゅうぼう・・・
って読んじゃったヨ ヽ(´ー`)ノ

395 :Mr.名無しさん:02/06/30 07:42
いま、罰金OFF中ですか?(^_^;

396 :Mr.名無しさん:02/06/30 08:22
罰金中です

397 :bakatank@male@カツヲ:02/06/30 16:30
マシン二台とも計算終了しているのに罰金中…
酷いや姉さん!

398 :Mr.名無しさん:02/07/01 09:25
罰金早くおわんねーかな

399 :Mr.名無しさん:02/07/01 10:10
やっと来た!

400 :hitsuji@ノハ@male:02/07/01 11:35
1日1リザルトしかUD鯖が受け付けてくれない雰囲気
なので、殆どのますんは様子を見るということで停止しました

Blackface@ノハ@maleなんか24時間動かして6.5Hしか稼動してないし
2個目を送ろうとして罰金だと思うので稼動は12Hくらいかな

狼が出没して牧場に放せないという罠

401 :Mr.名無しさん:02/07/01 13:19
>>400
そうそう、私も3台動かしてて、どれか1台が送信に成功したら他の2台のUDM(Result待ち)
を切り替えて送信しようとしてんですが、ほぼ100%受け付けてくれませんよね。
送信元のIPでも見てるのか?

402 :Mr.名無しさん:02/07/01 22:25
age

403 :Mr.名無しさん:02/07/02 14:16
うんこ保守

404 :hitsuji@ノハ@male:02/07/02 14:35
[倉庫での監禁はいやぁ]

最近まで分子モデルが巨大化してたのに
さっきみたら、初期のモデルのようにほっそりとしてますね

toroliさんの日記にも書いてあったけど、
分子モデルに凝るんだったら、罰金の方を先に解決してほしいね

昨日今日と最高気温が27〜28度
マシンの熱暴走に気をつけようね

405 :Mr.名無しさん:02/07/02 17:18
うんうん、先細ドリチンだね
暑くなってきたせいか家に帰ってきたら
PCが固まってることがあるよ

406 :Mr.名無しさん:02/07/02 19:59
クンクンクンクンクンクンクンクンクンクンクンクン
晩飯食ってるとき、両隣に女の人が
座ったんだけど、なんであんなに
良い匂いなんだろうねぇ〜
クンクンクンクンクンクンクンクンクンクンクンクン

407 :独身匪賊:02/07/02 20:16
サーバーの不調についてアナウンス出てます。課題の結果データが予想より
大き過ぎてサーバーが過負荷状態になったそうだす。カコワル
http://forum.ud.com/ubbcgi/ultimatebb.cgi?ubb=get_topic;f=2;t=000030

ちなみに暫定版としてバージョン番号の変わらない LigandFit を出した
そうです。出力だけが変わっているそうな。
http://forum.ud.com/ubbcgi/ultimatebb.cgi?ubb=get_topic;f=1;t=000139

おぱーい、と言い続けていたせいか最近とうとうオパーイ星人になって
しまいますた。ところで友達の情報によると、今週はイエローキャブ
(小池栄子、MEGUMIが所属するプロダクション)の中島はるみという
バスト103cmの娘が週プレに載るそうで、帰りがけに買い求めマターリ
観賞しようと思います。それではごきげんようです。おぱーい


408 :Mr.名無しさん:02/07/02 21:00
週プレのグラビア、安達祐実かよ!
明日買ってこよう。
で、中島はるみってどんな娘かなーって
検索したのに、どこにも画像が
ありませんよ。どーゆーことですか?

409 :hitsuji@ノハ@male:02/07/02 22:22
今日のお昼はマックで食べたんですが通りに面した所にカウンターがあって
人が行き来するのが良く見えるのです

もちろんオパ〜イチェックはしました女子高生、子供連れの主婦、OLなど

もともとオパ〜イ星人属性なので最近の暑さで薄着になるにつれ
友達や近くにいる人のオパ〜イに目が逝ってしまう罠
尾根遺産の店では1回はお願いしてみるし…

中島はるみタン、昔のアイドルの方なら…

410 :どぞっ!:02/07/03 09:28
中島はるみ
ttp://www.na.sakura.ne.jp/~time/buromai/nakajima/nakajimaPg00.htm

411 :Mr.名無しさん:02/07/03 09:45
あっ、あれっ?
気のせいか「昭和34年生まれ」とか書いてあるんですけど・・・。

412 :Myna ◆SxxeNENA :02/07/03 11:25
>>411
今、イエローキャブを見に行き週プレのページを確認してわかりました。
「中島はるみ」ではなく「根本はるみ}です。

こんな人↓
ttp://www.yellow-cab.co.jp/prof/nemoto.phtml

413 :Mr.名無しさん:02/07/03 11:59
>>412
ハァハァ・・・
オパーイ大きいっすね。
Iカプー?窒息しそう

414 :独身匪賊@観賞で寝不足:02/07/03 13:00
すいません、名前を間違えました。 (T∀T)ガクーリ

ちなみに写真見たところ、乳だけ別物という体つきでした。
まだ20そこそこなので将来は肉付きよい(・∀・)ベリーゴジャースな
女に育ってくれるかと期待してます。

ちなみに ttp://www.senmai.jp/vote/touhyou.html で
イエローキャブ組が勝つとTVで観賞できそうですね。
書く事もないので、これで失礼します(・∀・)オパーイ


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